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MEGA是一款專業(yè)的分子進化遺傳分析工具,全名為:Molecular Evolutionary Genetics Analysis。該軟件為用戶提供免費的分子進化分析功能,使得遺傳分析過程更加簡單高效。它支持打開替代矩陣和估計轉(zhuǎn)換/轉(zhuǎn)化偏差,同時能夠計算MCL替換矩陣。如有興趣,用戶可以通過kk下載分享的鏈接獲取此軟件。
MEGA(分子進化遺傳分析軟件)使用指南
如何將MEGA7.0格式轉(zhuǎn)換為可用格式?
1、啟動MEGA7.0軟件,了解軟件界面。
2、在左上角找到【Align】選項,點擊并選擇【Edit/Build Alignment】。接著會彈出一個窗口,點擊【OK】確認。
3、點擊【OK】后,會出現(xiàn)另一個窗口,需要選擇protein或DNA類型,根據(jù)需求選擇。這里以protein為例,選擇后繼續(xù)在新窗口中操作。
4、按照圖中箭頭指示,點擊【Edit】并選擇【Insert Sequence From File Ctrl+I】。然后在文件夾中找到目標FASTA格式的序列,選定后打開。
5、打開序列后,小窗口會出現(xiàn)。在左上角選擇【Date】,然后在子菜單選擇【Export Alignment】【MEGA Format】。
6、為剛才打開的文件命名并選擇存儲位置。命名完成后點擊【保存】,在彈出的窗口中輸入與之前相同的文件名,點擊【OK】以完成格式轉(zhuǎn)換。
MEGA (分子進化遺傳分析軟件) 特點
1、序列分析功能
系統(tǒng)發(fā)育推斷
模型選擇
混合與時鐘
祖先遺傳
選擇與測試
序列對比
2、統(tǒng)計分析方法
最大似然法
距離法
普通最小二乘法
簡化最大法
復(fù)合似然法
貝葉斯方法
3、強大可視化工具
序列比對/編輯器
樹形構(gòu)建器
數(shù)據(jù)探測工具
圖形生成器
基因拷貝向?qū)?br />
時間樹向?qū)?/p>
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MEGA V7.0.14 綠色版下載地址

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